Käänteinen suunnittelu eli reverse engineering on valitettavan yleistä nykyään. Suunnittelijoille on kuitenkin olemassa keinoja, joiden avulla piirien salat saadaan piilotettua erittäin tiukasti. Tehokkaimpia keinoja on käyttää laitteistoa, joka piilottaa esimerkiksi oheislaiteliitännät.
Eri mikro-ohjaimissa käytetään erilaisia tapoja suojata flash-muistiin tallennetua koodia luvatonta käyttöä vastaan. Jotkut eivät tuo minkäänlaista suojaa. Korkeammalla tasolla kaikki ratkaisut liittyvät lukemisen estämiseen flash-muistista. Jotkut ohjaimet estävät lukemisen ja kirjoittamisen koko flash-muistijärjestelmään. Tämä tekee käynnistyslataimen (bootloader) lisäämisen lopputuotteeseen mahdottomaksi.
Jotkut mikro-ohjaimet jakavat flash-muistin lohkoihin, joissa jokaisessa suojaus toteutetaan eritasoisesti. Tällaisissa laitteissa on mahdollista toteuttaa käynnistylohko ja silti saavuttaa korkea suojaustaso. Esimerkiksi PSoC1-piireissä suojaus on mahdolista tehdä monin eri tavoin.
Cypressin sovellusinsinööri Sachin Gupta on kirjoittanut artikkelin, jossa kuvataan erilaisia tapoja suojata järjestelmäpiirin IP. Teksti löytyy artikkeliosuudestamme.